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イスタンブール発のトルコ航空など、国際線のオンラインチェックインでは、座席指定に料金がかかる場合があります。オンライン登録時に自動で座席が割り当てられた後でも、座席を変更する場合は通常手数料が発生します。これは、オンラインチェックイン時の座席変更が無料であることが多いロシアの航空会社とは対照的です。
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イスタンブール空港（IST）発のFlyone便では、オンラインチェックインは通常出発の12時間前から利用可能になり、4時間前に終了します。空港での直接のチェックインには手数料がかかる場合があります。制限エリア内でチェックインが可能かもしれないという未確認の報告もあります。
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イスタンブール新空港発のアエロフロート便を利用する場合、空港のアプリでチェックインセクター情報（通常MからSの範囲）を確認してください。アエロフロート便はRセクターで確認されています。オンラインでの預け入れ手荷物チェックインは利用できません。カウンターが開いたらチェックインカウンターへ向かってください。
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イスタンブール～パリ線を含むTransavia便では、オンラインチェックイン時の事前座席指定には料金がかかることがよくあります。これは多くの航空会社、特に格安航空会社で一般的な慣行です。通常は空港で無料でチェックインすることもできますが、座席はランダムに割り当てられます。航空会社によっては空港でのチェックイン自体に手数料を課す場合があるため、Transaviaのウェブサイトで特定のポリシーを確認するか、到着時に座席が割り当てられることに備えておくことをお勧めします。
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AJetや同様の格安航空会社は、手荷物の寸法を厳密に定義しています（例：1辺あたり40x30x15cm）。逸脱するとゲートで拒否されるリスクがあります。座席指定は通常有料のオプションです。オンラインチェックイン時の自動座席割り当ては、同じ予約の乗客が隣り合わせになることを保証するものではありません。並んで座ることを確実にするには、乗客は事前に座席指定を購入する必要があります。